2009年6月11日，全国非遗保护、古籍保护暨文博事业杰出人物表彰、颁证、授牌电视电话会议在京召开，会议公布了经国务院批准的第二批4478部《国家珍贵古籍名录》和第二批62家全国古籍重点保护单位的名单。此前，经北京市古籍保护中心与各有关单位努力合作，北京地区共有5家市属藏书单位向国家申报了第二批《国家珍贵古籍名录》。最终，有4家单位的75种珍品成功入选名录，其中首都图书馆62种、中国书店8种、北京市文物局1种、首都师范大学4种。
首都图书馆入选第二批《国家珍贵古籍名录》的藏品有：元杭州大街众安桥北沈七郎经铺刻《药师琉璃光如来本愿功德经》、明嘉靖刻本《塞语》、明隆庆四年独醒居士刻本《酒史》、清乾隆五十四年舒元炜序抄本《红楼梦》等。至此，首都图书馆先后入选第一批、第二批《国家珍贵古籍名录》的善本古籍已到达65种。
中国书店入选的藏品有：明嘉靖刻本《春秋经传集解》、明嘉靖四至六年王延喆刻本《史记》、明嘉靖六至七年胡缵宗、陆采刻本《艺文类聚》、明嘉靖十年锡山安国桂坡馆刻本《初学记》、明嘉靖十五年玉几山人刻明昜山人印本《集千家注杜工部诗集》、明刻朱墨套印本《韩文公文抄》、明嘉靖三十五年莫如士刻本《韩柳文》、明成化十八年张世用刻本《古文苑》。
北京市文物局此次入选的为明弘治十七年钦天监刻本《大明弘治十七年岁次甲子大统历》。
首都师范大学入选的4种珍贵古籍为：宋淳熙二年严陵郡庠刻递修本《通鉴纪事本末》（存卷十八）、明嘉靖三十八年包柽芳刻本《苑诗类选》、明闵尔容刻三色套印本《苏文》、明正德八年华坚兰雪堂铜活字印本《白氏长庆集》（存一至二十六、目录全）。
国家珍贵古籍名录的申报工作今后还将继续进行，北京市古籍保护中心希望为更多的北京地区藏书单位提供申报的相关服务，以期有更多的珍贵古籍得以入选，更好的受到保护。
