2008年11月19日，文化部办公厅下发了《关于申报第二批〈国家珍贵古籍名录〉及第二批“全国古籍重点保护单位”的通知》。北京市古籍保护中心认真履行工作职责，向市属古籍收藏单位中国书店、北京市文物局、首都师范大学图书馆、首都医科大学图书馆等四家单位转发了文化部办公厅文件、《古籍定级标准》与《国家珍贵古籍名录申报书（样书）》，接受以上单位关于申报工作的专业咨询，之后将以上单位的申报情况进行汇总，统一上报国家古籍保护中心。具体申报情况如下：
一、《国家珍贵古籍名录》申报情况：5家单位共申报186种，即首都图书馆145种、中国书店18种、首都师范大学12种、首都医科大学8种、北京市文物局3种。
二、“全国古籍重点保护单位”申报情况：北京市文物局申报了第二批“全国古籍重点保护单位”。
